1、价格昂贵：这也是阻碍PET-CT推广的一个重要原因。

　　2、PET-CT有一定的假阳性率：有些非肿瘤组织(如炎性病灶)可在扫描时也表现为高代谢病灶，与肿瘤组织非常相似，有时难以区分。另外，有一部分正常组织也可能表现为18F-FDG摄取增高，需要综合各种临床资料进行分析判断。

　　3、少数恶性肿瘤可能无法通过PET-CT检测出来：有一小部分肿瘤对18F-FDG的摄取不高，所以进行PET-CT扫描时无法显示出来。

　　4、PET-CT接受的辐射剂量较大：做一次PET-CT全身扫描的辐射量相当于做二次CT扫描，所以PET-CT虽然有很多优势，也应该在有充分的临床理由后去做PET-CT检查，并应采取保护措施，以减少接受的辐射剂量。