医学界公认的恶性肿瘤治疗手段主要有三种：一是外科手术;二是放射治疗，即放疗;三是化学药物治疗，即化疗。质子重离子治疗是放射治疗的一种，是运用质子或重离子射线轰击肿瘤细胞，损伤肿瘤细胞DNA以达到杀死肿瘤的目的。

　　不过，质子重离子放疗对于恶性肿瘤来说也不是无所不能的。血液恶性肿瘤，如白血病;肿瘤已经发生多处远处转移并且转移灶≥3个;同一部位在1年内接受过放射治疗者或者粒子植入者;空腔脏器恶性肿瘤，如食道癌、胃癌、肠癌等暂时不考虑质子重离子放疗。

　　一般来说，普通的光子放疗适应症的肿瘤基本也适合质子重离子放射治疗，但其独特的放射生物学和放射物理学特性又使得其适应症范围有所放宽。对于脑和脊髓肿瘤，眼部肿瘤，头颈部肿瘤，胸腹部肿瘤，盆腔肿瘤以及儿科肿瘤治疗效果较好。